Studio delle mutazioni e alterazioni genetiche
L’Oncologia molecolare è una disciplina che unisce le competenze della biologia molecolare con quelle dell’oncologia, il cui scopo è studiare le mutazioni e le alterazioni genetiche a carico di specifici geni o di intere porzioni cromosomiche coinvolte nello sviluppo del cancro.
La profilazione genica è una delle più importanti innovazioni delle conoscenze nella terapia dei tumori e sta diventando una tematica ampiamente discussa sia da un punto di vista clinico, che in ordine tecnologico e organizzativo. Un’evoluzione, questa, che si traduce in un progresso delle conoscenze e nell’evoluzione dei test bio-molecolari, oltre che nello sviluppo della ricerca traslazionale e clinica.
A tal proposito, l’identificazione di uno o più specifici marcatori molecolari su campioni tumorali è di fondamentale importanza, poiché fornisce indicazioni sul trattamento farmacologico più idoneo sia in termini di specificità, sia in termini di efficacia, limitando o evitando effetti collaterali indesiderati.
Pertanto, individuare precocemente mutazioni a livello germinale, che predispongano all’insorgenza di tumori ereditari, permette di definire un percorso di sorveglianza dei pazienti a rischio e individuare altri soggetti della stessa famiglia esposti all’eventuale insorgenza della stessa neoplasia.
Analisi di Farmacogenetica su DNA/RNA somatico
TIPOLOGIA DI TUMORE | GENI INTERESSATI | TARGET | TIPOLOGIA DI ANALISI | campione biologico di partenza |
CARCINOMA DEL COLON-RETTO | KRAS, NRAS e BRAF | codoni 12 e 13 nell’esone 2 codoni 59 e 61 nell’esone 3 e codoni 117 e 146 nei geni KRAS e NRAS codone 600 nel gene BRAF
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Real time PCR | Tessuti FFPE o tessuti da biopsia |
CARCINOMA POLMONARE NON A PICCOLE CELLULE | EGFR | principali mutazioni degli esoni 18, 19, 20, 21 nel gene EGFR
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Real time PCR | Tessuti FFPE o tessuti da biopsia |
CARCINOMA POLMONARE NON A PICCOLE CELLULE | EGFR | varianti p.T790M e p.C797S nel gene EGFR
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Real time PCR | Tessuti FFPE o tessuti da biopsia |
TUMORE DELLA TIROIDE | KRAS, NRAS, HRAS, BRAF | Codoni 12 e 13 dell’esone 2 e codone 61 dell’esone 3 nei geni KRAS, NRAS e HRAS e codoni 600 e 601 nel gene BRAF
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Real time PCR | Tessuti FFPE o tessuti da biopsia |
TUMORE DELLA TIROIDE | RET, PTC1, CCDC6, PTC2, PRKAR1A, PTC3, NCOA4, PAX8, PPARG | Traslocazioni cromosomiche RET/PTC1:CCDC6-RET; RET/PTC2:PRKAR1A-RET; RET/PTC3:NCOA4-RET e PAX8/PPARG
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Real time PCR | Tessuti FFPE o tessuti da biopsia |
MELANOMA | NRAS e BRAF | codoni 12 e 13 nell’esone 2 codoni 59 e 61 nell’esone 3 e codoni 117 e 146 nel gene NRAS codone 600 nel gene BRAF
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Real time PCR | Tessuti FFPE o tessuti da biopsia |
Farmacogenetica: Analisi Polimorfismi DPYD e UGT1A1
TIPOLOGIA DI TUMORE | GENI INTERESSATI | TARGET | TIPOLOGIA DI ANALISI | campione biologico di partenza |
TRATTAMENTO CON FLUOROPIRIMIDINE | DPYD | polimorfismi DPYD*2A (IVS14+1G>A, c.1905+1G>A, rs3918290), DPYD*13 (c.1679T>G, rs55886062), DPYD c.2846A>T (rs67376798) e DPYD IVS10 (c.1129-5923C>G)
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Real time PCR | Sangue (EDTA o citrato) |
TRATTAMENTO CON IRINOTECANO | UGT1A1 | polimorfismi UGT1A1A1*36(TA)5, UGT1A1*1*1(TA)6, UGT1A1*28(TA)7, UGT1A1A1*37(TA)8
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Real time PCR | Sangue (EDTA o citrato) |